Nevét onnan kapta, hogy templomát a Szent Kereszt tiszteletére emelték.Ugyanakkor a helység fölé magasodó ”Jézuskiáltó” és a rajta álló kereszt is a város nevével van összefüggésben.
„A Gagy pataka völgyében, a Nagy-Küküllő mellett lovagok vertek tanyát még a szentföldi harcok idején. Előbb csak pihenőként használták, majd lassan házak jelentek meg és nem telt bele sok idő, település született. Ez a mai Székelykeresztúr.”